| 大学名 | 課程 | 教育コース名 | URL |
| 北海道大学大学院 医理工学院 | 修士課程 | 医理工学院 医学物理士プログラム | https://www.med.hokudai.ac.jp/bme/medical-physicists.html |
| 北海道大学大学院 | 博士課程 | 医学院 先端医学物理学コース | |
| 博士課程 | 医理工学院 医学物理士プログラム | https://www.med.hokudai.ac.jp/bme/medical-physicists.html |
| 東北大学大学院 医学系研究科 | 修士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.rt-medphys.med.tohoku.ac.jp/ |
| 博士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.rt-medphys.med.tohoku.ac.jp/ |
| 新潟大学大学院 保健学研究科 | 博士前期課程 | 医学物理士養成コース | https://www.med.niigata-u.ac.jp/gan/course05.html |
| 博士課程 | 医学物理コース | http://www.med.niigata-u.ac.jp/gan/course08.html |
| 新潟大学医歯学総合病院 | 臨床研修課程 | 次世代対応医学物理士レジデントコース | https://www.med.niigata-u.ac.jp/rad/medphys/resident/index.html |
| 短期臨床研修教育コース | 次世代対応医学物理士短期臨床研修コース | https://www.med.niigata-u.ac.jp/gan/course10.html |
| 群馬大学大学院 医学系研究科 生命医科学専攻 | 修士課程 | 医学物理コース | https://heavy-ion.showa.gunma-u.ac.jp/lab/ |
| 群馬大学大学院 理工学府 | 博士前期課程 | 重粒子線医工学グローバルリーダー養成プログラム(医学物理コース) | https://lphd.dept.showa.gunma-u.ac.jp/?page_id=2104 |
| 群馬県立県民健康科学大学大学院 診療放射線学研究科 | 修士課程 | 医学物理コース | https://www.gchs.ac.jp/graduateschool/of_medicalradiation/feature-rad |
| 筑波大学大学院 人間総合科学研究科 | 修士課程 | フロンティア医科学学位プログラム 医学物理学 | http://www.md.tsukuba.ac.jp/FrontierSite/curriculum/program/medical_physics.html |
| 博士課程 | 医学学位プログラム 医学物理学分野 | https://med-physics.md.tsukuba.ac.jp/ |
| 臨床研修課程 | 医学物理士レジデントプログラム | https://www.pmrc.tsukuba.ac.jp/radioncology/for_medical_physicists/training_schedule/ |
| 茨城県立医療大学大学院 保健医療科学研究科 放射線技術科学専攻 | 博士前期課程 | 医学物理コース | https://www.ipu.ac.jp/about/page000594.html |
| 帝京大学大学院 医療技術学研究科 診療放射線学専攻 | 博士前期課程（修士課程） | 博士前期（修士）課程 医学物理士コース | https://www.teikyo-u.ac.jp/faculties/medicine_tech/radiation |
| 博士後期課程（博士課程） | 医学物理士コース | http://www.teikyo-u.ac.jp/index.html |
| 東京都立大学 人間健康科学研究科 放射線科学域 | 博士前期（修士）課程 | 医学物理士コース | https://www.tmu.ac.jp/academics/graduate/hs/housya.html |
| 博士後期（博士）課程 | 医学物理士コース | https://www.tmu.ac.jp/academics/graduate/hs/housya.html |
| 立教大学大学院 理学研究科 | 博士課程前期課程 | 医学物理学副専攻 | http://www2.rikkyo.ac.jp/web/med-phys/ |
| 博士課程後期課程 | 医学物理学副専攻 | http://www2.rikkyo.ac.jp/web/med-phys/ |
| 東京大学大学院 医学系研究科 生体物理医学専攻 | 博士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.u-tokyo-rad.jp/staff/recruitment/ |
| 順天堂大学大学院 医学研究科 | 修士課程 | 放射線治療学医学物理士コース | https://www.juntendo.ac.jp/academics/graduate/med/master/about/ |
| 博士課程 | 放射線治療学医学物理士コース | https://www.juntendo.ac.jp/academics/graduate/med/doctor/about/ |
| 東京女子医科大学 医学研究科 放射線腫瘍学分野 | 博士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.twmu.ac.jp/univ/graduate/medical/field/detail.php?id=04014 |
| 国際医療福祉大学大学院 医療福祉学研究科 保健医療学専攻 放射線・情報科学分野 | 修士課程 | 放射線治療学領域医学物理コース | https://www.iuhw.ac.jp/daigakuin/faculty/health_welfare/housha/index.html |
| 国立がん研究センター | 臨床研修課程 | 医学物理士レジデント | https://www.ncc.go.jp/jp/ncch/division/radiation_qulity_cotrol/030/index.html |
| 駒澤大学大学院 医療健康科学研究科 | 修士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.komazawa-u.ac.jp/academics/graduate/health-sciences/health-sciences.html |
| 昭和大学大学院 | 修士課程 | 保健医療学研究科 医学物理教育分野 | https://www.showa-u.ac.jp/education/grad_nr/ |
| 北里大学大学院 医療系研究科 | 修士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.kitasato-u.ac.jp/jp/kugsms/education/master/medical_physicist_course.html |
| 東海大学大学院 医学系研究科 放射線治療科学 | 修士課程 | 医学物理士養成コース | https://www.med.u-tokai.ac.jp/daigakuin/web/ganpro/ganpro2.html |
| 名古屋大学大学院 医学系研究科 | 修士課程 | 医学物理士コース | https://www.met.nagoya-u.ac.jp/GRADUATE/radmed.html |
| 藤田医科大学大学院 保健学研究科 保健学専攻 医用放射線科学領域 | 修士課程 | 医学物理学分野 | https://www.fujita-hu.ac.jp/faculty/unit/mp/top.html |
| 京都大学大学院 医学研究科 | 修士課程 | 医学物理士養成コース | https://medicalphysics.hs.med.kyoto-u.ac.jp/ |
| 博士課程 | 医学物理士養成コース | https://medicalphysics.hs.med.kyoto-u.ac.jp/ |
| 大阪大学大学院 医学系研究科 | 修士課程 | 保健学専攻 先端医学物理コース I/II | https://sahswww.med.osaka-u.ac.jp/jpn/guide2/igaku-butsuri.html |
| 博士課程 | 医学専攻 ゲノム世代高度臨床医学物理士養成コース | http://www.radonc.med.osaka-u.ac.jp/ |
| 博士課程 | 保健学専攻 先進ゲノム医学物理コース | https://sahswww.med.osaka-u.ac.jp/jpn/guide2/igaku-butsuri.html |
| 近畿大学大学院 医学研究科 医学物理学専攻 | 博士課程 | 高度先端医学物理研究者養成コース | https://www.med.kindai.ac.jp/radio/index.html |
| 神戸大学大学院 医学研究科 内科系講座 放射線腫瘍学分野 | 修士課程 | 地域密着型医学物理スペシャリスト養成コース | https://www.med.kobe-u.ac.jp/education/bs/exam/ganpro.html |
| 広島大学大学院 医系科学研究科 | 修士課程 | 総合健康科学専攻 医学物理士プログラム | https://housya.hiroshima-u.ac.jp/medical_physics/ |
| 博士課程 | 医歯科学専攻 | https://housya.hiroshima-u.ac.jp/medical_physics/ |
| 徳島大学大学院 保健学研究科 | 修士課程 | 医学物理学コース | https://www.tokushima-u.ac.jp/med/health_science/graduate_school/biomedical_sciences/ |
| 九州大学大学院 医学系学府 保健学専攻 医用量子線科学分野 | 修士課程 | 医学物理士・放射線治療品質管理士養成コース | https://web.shs.kyushu-u.ac.jp/~mp/ |
| 帝京大学福岡大学院 保健学研究科 診療放射線科学専攻 | 修士課程 | 医学物理教育コース | https://www.teikyo-u.ac.jp/faculties/health_sciences/radiological_sciences |